Trước đây, Mỹ Xuân là một xã thuộc huyện Châu Thành cũ, được thành lập vào ngày 8 tháng 12 năm 1982 trên cơ sở tách một phần diện tích và dân số của xã Phú Mỹ.[3]

Ngày 2 tháng 6 năm 1994, xã Mỹ Xuân trực thuộc huyện Tân Thành mới thành lập.[4]

Ngày 12 tháng 4 năm 2018, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 492/NQ-UBTVQH14[1]. Theo đó, chuyển huyện Tân Thành thành thị xã Phú Mỹ và thành lập phường Mỹ Xuân trên cơ sở toàn bộ 38,93 km² diện tích tự nhiên, 32.345 người của xã Mỹ Xuân.